股权转让100万元的税费需分主体、分场景计算，核心涉及印花税、个人所得税及企业所得税三大税种。
(一)印花税：双向征收，税率0.05%
根据《中华人民共和国印花税法》及2025年最新政策，股权转让协议属于“产权转移书据”，转让方与受让方均需按协议金额的0.05%缴纳印花税。
实务要点：
1.印花税以协议金额为计税依据，不包括列明的认缴后尚未实际出资权益部分;
2.若转让价格明显偏低且无正当理由，税务机关可按净资产核定法调整计税依据。
例如，某企业净资产为1500万元，股东转让10%股权(原值100万元)时，若申报转让收入为100万元，税务机关可能按150万元(1500万×10%)核定收入，导致印花税增加至750元(150万×0.05%)。
(二)个人所得税：自然人转让适用20%税率
若转让方为自然人，需按“财产转让所得”缴纳个人所得税，计算公式为：
应纳税额=(股权转让收入-股权原值-合理费用)×20%
其中，股权原值通常为取得股权时的实际支出，合理费用包括印花税、评估费等。
例如，自然人A以100万元转让原值60万元的股权，支付评估费2万元，则应纳税额为(100万-60万-2万)×20%=7.6万元。
核定收入情形：
若申报收入明显偏低且无正当理由，税务机关可按以下方法核定：
1.净资产核定法：按每股净资产或股权对应净资产份额计算。
例如，某企业净资产为1200万元，股东转让8%股权时，若申报收入为80万元，税务机关可能按96万元(1200万×8%)核定收入，导致个税增加至(96万-原值-费用)×20%;
2.类比法：参照相同条件下同类企业或同一企业其他股东的转让收入核定。
正当理由豁免：
符合以下情形之一的，低价转让可免于核定：
1.继承或将股权转让给配偶、父母、子女等直系亲属;
2.企业因国家政策调整导致经营受重大影响，且能提供有效证明文件;
3.股权转让双方能够提供合理性的其他证据(如员工内部转让)。
(三)企业所得税：法人股东适用25%税率
若转让方为企业，需将股权转让所得并入当期应纳税所得额，按25%税率缴纳企业所得税(小微企业可享5%或10%优惠税率)。计算公式为：
应纳税额=(股权转让收入-股权计税成本)×企业所得税税率
例如，企业B以100万元转让原值70万元的股权，若适用25%税率，则应纳税额为(100万-70万)×25%=7.5万元。
特殊情形：
法律依据：
《中华人民共和国印花税法》第一条
在中华人民共和国境内书立应税凭证、进行证券交易的单位和个人，为印花税的纳税人，应当依照本法规定缴纳印花税。应税产权转移书据的计税依据，为产权转移书据所列的金额，不包括列明的增值税税款。
《中华人民共和国企业所得税法》第四条
企业所得税的税率为25%。企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
零元转让股权(即无偿转让)的税务处理需区分场景，核心争议点在于“是否被认定为真实低价转让”及“是否具备正当理由”。
(一)印花税：按协议金额计算，零元转让可能免税
根据印花税政策，若股权转让协议明确约定转让价格为0元，且能提供合理证明材料(如亲属关系证明、继承文件等)，则无需缴纳印花税。但若税务机关认定转让价格明显偏低且无正当理由，可能按净资产核定法调整计税依据。
例如，某企业净资产为2000万元，股东将10%股权以0元转让给子女，虽协议金额为0，但税务机关可能按200万元(2000万×10%)核定收入，导致双方各需缴纳1000元印花税(200万×0.05%)。
(二)个人所得税：无偿转让需满足“正当理由”
自然人零元转让股权时，若不符合以下“正当理由”情形，税务机关可能按净资产核定法调整收入并征收个税：
1.继承或将股权转让给配偶、父母、子女等直系亲属;
2.企业因国家政策调整导致经营受重大影响，且能提供有效证明文件;
3.股权转让双方能够提供合理性的其他证据(如员工内部转让)。
案例：
反之，若张某将股权转让给无亲属关系的员工，且无法提供合理性证明，税务机关可能按企业净资产份额核定收入为80万元(企业净资产1600万×5%)，张某需缴纳个税(80万-50万)×20%=6万元。
(三)企业所得税：法人股东需按公允价值确认所得
企业零元转让股权时，需按公允价值确认收入并计算企业所得税。
例如，企业C将持有子公司20%股权(计税成本100万元)以0元转让给关联方，若税务机关核定公允价值为150万元，则企业C需确认所得50万元(150万-100万)，并按25%税率缴纳企业所得税12.5万元。
法律依据：
《中华人民共和国印花税法》第一条
在中华人民共和国境内书立应税凭证、进行证券交易的单位和个人，为印花税的纳税人，应当依照本法规定缴纳印花税。应税产权转移书据的计税依据，为产权转移书据所列的金额，不包括列明的增值税税款。
《中华人民共和国企业所得税法》第四条
企业所得税的税率为25%。企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
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